南京市第二医院神经内科是我院优先发展的重点学科，南京中医药大学临床学院神经病学教研室设立于我科，承担南京中医药大学临床教学工作，目前我科共计人员12人，其中主任医师4人，主治医师3人，住院医师5人，均为硕士及以上学历。以王蔚主任医师为代表的专家团队为我科奠定了雄厚的学术和医疗基础，病人覆盖全省及全国各地，是集临床、教学、科研、康复、预防为一体的神经专科。
科室医师团队具有丰富的临床经验和扎实的理论基础，尤其在疑难病诊治、危重症患者抢救方面具有丰富的临床经验，能解决本地区疑难、危重症患者的救治难题。
本学科拥有多种神经病学临床及实验研究设备，包括128排螺旋CT、1.5T和3.0T核磁共振（MRI）、数字减影血管造影（DSA）、视频动态脑电图、肌电图、诱发电位、经颅多普勒超声（TCD）、各种心电监护仪等医疗设备。
科室不仅注重临床工作，对于科研和教学也十分关注，目前承担南京中医药大学实习及教学工作，近年来在国内外杂志上发表学术论文多篇，积极申请、参与省市级相关研究课题。
脑血管病：我科建立了脑血管病院内急救体系，常规开展脑梗死的动静脉溶栓、脑血管造影、脑梗死、脑出血、蛛网膜下腔出血内科规范化诊治等。
中枢神经系统感染性疾病：我科常规开展脑脊液细胞学、生化、常规、免疫学测定、病原学二代测序技术、酶学测定等检查，在中枢神经系统感染性疾病诊疗有明显优势。
癫痫：目前我科拥有先进脑电图检查技术，其中包括普通脑电图，视频脑电图，24小时动态脑电图以及抗癫痫药物浓度监测等，积极筹备癫痫诊疗中心，让癫痫病患者接受内、外科及社会心理等全方位的整体综合治疗。
眩晕诊治：积极开展眩晕专科诊治，对良性阵发性位置性眩晕进行手法复位，普及、提高眩晕诊治水平。
其他疾病：痴呆，帕金森病，神经系统脱髓鞘疾病、遗传性疾病，神经-肌肉以及肌肉疾病等的诊治也是我科重点发展方向。
神经康复：我科拥有多种康复治疗仪器，可对患者进行早期康复治疗，促进患者神经功能障碍的恢复，缩短患者的住院时间，节省住院费用，使患者早日回归家庭及社会。